MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmid APP7_C

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010940	AT	3	6	35	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010940	TTA	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010940	AAAATA	2	12	104	115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010940	A	7	7	115	121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010940	TAT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010940	TGT	2	6	177	182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010940	ACT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010940	A	7	7	288	294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010940	CAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010940	CAAT	2	8	399	406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010940	TAC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010940	TTC	2	6	528	533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010940	TTG	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010940	ACT	2	6	644	649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010940	AAC	2	6	652	657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010940	TTA	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010940	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010940	A	6	6	912	917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010940	AAAAC	2	10	959	968	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010940	TAC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010940	GTA	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010940	TTAC	2	8	1177	1184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010940	AAT	2	6	1296	1301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010940	T	6	6	1346	1351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010940	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010940	TCA	2	6	1461	1466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010940	ATTTAT	2	12	1488	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010940	TC	3	6	1508	1513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010940	TTC	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010940	TCT	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010940	TAA	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010940	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010940	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010940	TTA	2	6	1764	1769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
35	NC_010940	TTGC	2	8	1789	1796	0 %	50 %	25 %	25 %	190151402
36	NC_010940	TTG	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151402
37	NC_010940	CT	3	6	1844	1849	0 %	50 %	0 %	50 %	190151402
38	NC_010940	AGT	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151402
39	NC_010940	ATTT	2	8	1940	1947	25 %	75 %	0 %	0 %	190151402
40	NC_010940	T	6	6	1945	1950	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
41	NC_010940	ATT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
42	NC_010940	GTTGA	2	10	2003	2012	20 %	40 %	40 %	0 %	190151402
43	NC_010940	C	6	6	2080	2085	0 %	0 %	0 %	100 %	190151402
44	NC_010940	TTC	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151402
45	NC_010940	T	6	6	2240	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
46	NC_010940	CTG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
47	NC_010940	CT	3	6	2363	2368	0 %	50 %	0 %	50 %	190151402
48	NC_010940	CTG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
49	NC_010940	TTGA	2	8	2463	2470	25 %	50 %	25 %	0 %	190151402
50	NC_010940	T	6	6	2475	2480	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
51	NC_010940	GTCG	2	8	2536	2543	0 %	25 %	50 %	25 %	190151402
52	NC_010940	CCGT	2	8	2577	2584	0 %	25 %	25 %	50 %	190151402
53	NC_010940	T	6	6	2603	2608	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
54	NC_010940	T	7	7	2640	2646	0 %	100 %	0 %	0 %	190151402
55	NC_010940	GTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190151402
56	NC_010940	GTA	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190151402
57	NC_010940	GCCT	2	8	2800	2807	0 %	25 %	25 %	50 %	190151402
58	NC_010940	GT	3	6	2814	2819	0 %	50 %	50 %	0 %	190151402
59	NC_010940	TTC	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190151402
60	NC_010940	TTA	2	6	2955	2960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190151402
61	NC_010940	GTC	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190151402
62	NC_010940	ACT	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190151402
63	NC_010940	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	190151402
64	NC_010940	T	6	6	3130	3135	0 %	100 %	0 %	0 %	190151403
65	NC_010940	T	7	7	3140	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	190151403
66	NC_010940	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	190151403
67	NC_010940	TTC	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.